永乐九年（1411年），朱棣结束第一次北征回到南京，由于没有收到锦衣卫有关太子所犯过错的密报，所以朱棣只是向文官杨士奇、耿通等人询问了太子监国期间的表现，杨士奇、耿通等人明显清楚朱棣有意等待朱高炽犯错后更换继承人，于是耿通给了朱棣"太子事无大过误，可无更也"的回答。
永乐十年，朱高煦密报耿通、杨士奇等人与太子结党，联系到之前耿通、杨士奇曾多次为太子开脱的情况朱棣认为朱高煦的密报是实情，所以就将耿通凌迟处死、将支持太子的杨士奇等人下狱，朝中支持太子的势力遭到重创。
永乐十二年，朱棣第二次北征凯旋，按照惯例，朱高炽应该提前安排使臣在边境迎驾，可是朱高炽安排的使臣金忠竟然延迟至朱棣距离北平只有两日路程时才迎驾，这对于朱高炽来说绝对是致命的错误，因为朱棣完全可以以此指责朱高炽目无君上、不忠不孝，然后再废除朱高炽的太子之位。
对此，杨士奇等文官也十分清楚，所以在朱棣问罪时，杨士奇等人皆言："殿下孝敬诚至，凡所稽违，皆臣等之罪"。
至此，朱棣终于明白太子之位只能是朱高炽的，因为通过杨士奇等人在明知迎驾延误是死罪的情况下还能为了保住朱高炽的太子之位而主动站出来认罪可知，杨士奇等人为了保住朱高炽的太子之位是不惜舍弃自己的性命的，如果此时自己还要坚持改立朱高煦为太子，那么接下来被舍弃性命的可能就是朱高煦了。所以，朱棣只是将杨士奇等人关进了监狱，并没有处决他们。
