于是他联合朝中大臣将泰定帝的心腹官员全部收监，借此安插心腹，同时派人迎接元武宗的两个儿子入朝。不久，元武宗的小儿子先一步入朝被拥立为新君即元文宗。
而此时，泰定帝的旧臣在上都拥立其子为帝，并且集结大军讨伐大都。身在大都的燕铁木儿早就胸有成竹，他们以逸待劳全歼来犯之敌。后来，他们又派兵攻打上都，将泰定帝的势力全部扫除。从而使得元文宗稳坐江山，从此他便深得元文宗的信任，元文宗将朝中大小事宜全部交给他，他便成为朝廷新贵，权倾朝野。
在元文宗即位之初，曾经当众表示等他的哥哥和世琜回来之后，将皇位禅让给哥哥。也许当时他也只是迫于形势随口一说，可是不巧的是就在同一年，元文宗的哥哥果真带来了一群拥护者回来了。正所谓：君无戏言。即使元文宗再怎么不愿意也只能将皇位禅让给哥哥和世琜即元明宗。
