景泰元年八月十五，中秋佳节，朱祁镇时隔一年重新回到北京，他由安定门入城，朱祁钰亲自迎接。兄弟两人执手含泪，相拥而泣。随后，朱祁镇被送往南宫居住。为了避免朱祁镇和旧臣来往，朱祁钰名人对南宫严加看管，甚至连宫内的大树都全部砍伐掉，以便监视。
在安顿好朱祁镇之后，朱祁钰的心态发生了重要变化，接下来，朱祁钰做了一件不厚道的事情。他要废除朱见深的太子之位，因为朱见深是哥哥的儿子。朱祁钰想立自己的儿子朱见济为太子，想把皇位彻底变成一家之私。这个举动，得到了大臣的反对，孙太后虽然也反对，但已无力改变，孙太后用自己的能力，一直保护朱祁镇和朱见深的安全。
景泰三年，朱祁镇虽然废除了朱见深，但没想到的是，他的儿子朱见济却夭折了，就这样，明朝的太子之位空悬了。有一位叫钟同的官员曾上书道：朱见济夭折，这是天命，为了大明朝的国本，应该复立朱见深为太子。朱祁钰大怒，竟然将钟同乱棍打死。《明史·钟同传》：
