燕王开军后，以藩属之力与朝中军队作战。建文帝再三听信黄子澄和方孝孺的错误建议，毁了大好局面。燕王起义后，迅速控制了北平地区，然后占领了保定，这和北京、保定不一样。耿炳文是朝廷老将军，率军参战。燕王在战场上有很长的经验，都是优秀的。他在前线战场上被耿炳文打败。耿炳文善于守住正定（现石家庄市正定区），于是燕王退场。
这时，建文帝又犯了一个错误。他听取了黄子澄和方孝孺的建议，让李景龙接替耿炳文。李景隆是国家缔造者李文忠的儿子。他是个典型的花花公子。他的军事能力远不如守卫边塞的燕王。60万大军已无招架之力，明朝的精英势力已不复存在。从那时起，燕兵每天都在胜利，他们面对着城市。
方孝孺却建议建文帝死守社稷，此时的燕军孤军深入，其所控制的区域不过河北一带，兵马是燕军和宁王朱权所部，绝大多数地区归朝廷控制，倘若建文帝撤离国都，诏令天下讨伐燕藩，断不会将江山拱手让出，最终建文帝自焚于皇宫（一说出家逃离），明朝皇位嬗变。从历史发展的角度看，燕王朱棣有着卓越的才能，比朱允炆更善于治国。京南战役的胜利，对中国的进程产生了更大的积极影响。
