最终问题也算得到妥善解决，在清王朝平定准格尔叛乱之时，我们更多的是关注康熙，雍正，乾隆三代对于西蒙古的征服，对新疆的收复，但我们很少关注到清王朝再多次出兵西域之时，往往依靠掠夺，补充军粮。这种手段使得当地的蒙古人和少数民族人死于饥饿，造成民族矛盾。在第二次平定准格尔叛乱之时，清王朝所辖士兵开始大肆屠杀平民，为了彻底消除西北边患，但凡无法辨别是否叛乱与否都应该杀光，西蒙古部落的各族人民遭受灭顶之灾。
一些蒙古部落并无反叛之意，相反有投靠之意，也被清王朝设计剿灭，屠杀人数以万计，乾隆时期面对西蒙古叛乱反复无常，乾隆帝曾亲自下诏不管老幼凌弱，一律严加审查，当先头部队开始执行这道圣旨之时，便演变为对准个部落平民的大屠杀。但凡居住在蒙古包内的人口一律杀光。一些部落剩下的人不得不逃到深山老林之中，乾隆并下令搜捕，要斩尽杀绝，部落首领无论反叛与否，都要押解回京。
