不过，棚改带来的负面影响也是很大的，主要有以下几点：第一，棚改货币化安置，人为拉开了社会贫富差距。自从棚改出台之后，很多棚户区居民巴望着本地区能“拆迁”。只要这里棚改一拆迁，胜过自己奋斗几十年。通过棚改实现财务自由的也大有人在。这些人一拿到动迁款，不是在网上炫耀财富，就是到外面去大肆消费。如果大家都靠棚改来改变命运，从此不用再工作，那么社会就会崇尚：好逸恶劳，一夜暴富，投机取巧。那我们社会还怎么进步和发展呢？
第二，棚改货币化安置。就是棚改居民拿了大量动迁款后，就跑到周边去购买商品房。这项政策本意是要消化当地的商品房库存，化解金融机构的风险。但问题是，你大量的动拆迁后，就形成了巨大的购房需求，大家都去周边买房，此时，再加上炒房团推波助澜，那当地房价怎么会不大涨？面对房价疯狂，当地居民直呼买不起，因为靠工资收入，肯定比不过棚改货币化居民的购房能力。这样是扰乱了当地房地产市场的正常秩序。
第三，“钉子户”的形成，使“棚改“推进并不顺利。在拆迁过程中，老实人拿了安置款，或者新房子钥匙就搬走了。但还有少数“钉子户”知道越是死杠，收益会越大，为了这人生的重大机会，开始漫天要价，声言不给这个数，就休想让我们搬走。于是，双方就这样僵持着，既影响到开发商的施工进度，也阻碍了交通，对城市的形象也起到了极为负面的影响。这些“钉子户”或提出要上千万或过亿的赔偿款，或者要求5套以上的房子，开发商直言越来越拆不起房了。
