很快，曾国藩弹劾翁同书的奏折送到了朝廷。这时候，同治皇帝已经继任，慈禧太后、慈安太后垂帘听政。那时候，曾国藩统领的湘军是抵抗太平军的主力部队，慈禧太后、慈安太后很重视曾国藩的奏折，便将翁同书革职逮问。经过王大臣审议，拟定了一个死刑。
翁心存得知儿子被判死刑，又急又气，生了重病。翁同书被暂时释放回家，在病床前伺候父亲。没过多久，翁心存病重不治，撒手人寰。考虑到这些情况，两宫太后和同治皇帝以眷念师傅的名义，改翁同书的斩刑为充军新疆。后来，翁同书改戍甘肃军营效力，3年后死在了陕西花马池。
对于翁同龢来说，父亲溘然长逝、兄长发配边疆，一个好好的家弄成如此凄凉光景，都是由曾国藩、李鸿章的一封奏折引起的。不过，那时候，翁同龢才刚刚进入仕途，只是一名六品京官，而曾国藩是两江总督，又是朝廷倚重的重臣，跟他较劲纯属自不量力，于是便迁怒于代笔的李鸿章。
此后，李鸿章就成了翁同龢一辈子的敌人了。
【参考资料：《清史稿》《参翁同书片》等】
