唐赛儿与白莲教的名声大振，附近的民众也响应起义军，越来越多的人前来投靠。不仅是唐赛儿的部下逐日壮大，山东各地也纷纷出现了起义军，大大小小也有数十只。起义军攻打官府，烧毁仓库，夺取粮食，威势大振，还有扩大的趋势。山东地方官吏惶恐不安，三司联名上报朝廷。明成祖朱棣闻报后大为震动，立即派遣官员，星夜赶往卸石棚寨招安。但唐赛儿态度坚决，不愿接受招安。
于是朝廷派出京师精兵，由安远候总兵柳升与都指挥刘忠统领，前来征讨。唐赛儿为人机巧，不与明朝军队正面对战，起义军往往周旋对敌，寻找明军破绽。但最终由于双方实力悬殊，唐赛儿的起义军最终还是被明军击溃。
关于唐赛儿的结局，民间众说纷纭。据说得知唐赛儿不见踪影后，朱棣大怒，他以"纵贼为乱不言"的罪名，处死了山东大批官员。据《明史纪事本末》记载：朱棣由于长久捉不到唐赛儿，又惧怕其削发为尼或混于女道士中。更是两次命令拘捕京师、山东境内的女尼和女道士，后又拘捕全国数万名女尼和女道士，并导致不少无辜民众死亡。
更有民间流传甚广的传说：唐赛儿为免无辜惨死，只得前往官府投案自首。官吏对唐赛儿怀恨在心，判她骑在木驴送往刑场凌迟处死。并且行刑后还明挂在城楼上示众。3天后唐赛儿才咽气。当然，这种传奇英雄也有类似被追兵追至绝境羽化升仙的传闻。
