台湾地区，从战国以来就有了记载，三国时期中原便与之有了往来，后来中原王朝陆陆续续设置了澎湖巡检司等机构对此进行管辖。
但是，当地一直有土著王国存在，中央对此的把控力依然不强，就算是割据台湾的郑明政权，也和土著的大肚王国并立着，未能全面把控台湾。
清朝收复台湾后，对台湾严加控制，打压大肚王国势力，镇压土著叛乱，设置台湾府，将台湾牢牢地纳入了中央政府的控制下。
清朝对边疆民族地区设置各级行政单位、派驻中央官员的政策，大大地加强了对这些地区的把控，同时也提高了当地经济文化水平的发展，增强了民族之间的认同感，民族共和的种子也在那个时候埋下了，为后来的中国版图打下了基础。
