驸马杨春元自行奉旨回京。万历皇帝见驸马有悔悟之意，于是让驸马到国子监学习礼法百日。百日过后，驸马父子官复原职。（1616年）七月，杨春元之母李氏病逝。他极度伤心，竟七日不食，于七月九日去世，年仅35岁。
杨春元死后，荣昌公主很守本分，没有做出一点有伤风雅的事情。但好景不长，公主的母亲王皇后和父亲万历皇帝相继崩逝，异母弟朱常洛继位，即明光宗。明光宗在位仅月余便驾崩，公主的侄子朱由校继位，即明熹宗。明熹宗封姑母荣昌公主为荣昌大长公主。
（1644年）三月，李自成率领的农民军攻入北京，崇祯自尽，明朝灭亡。其时公主已62岁，在国破家亡的这次劫难中，公主有三个儿子遇难，一个儿子夭亡，待到清朝统治者入主北京时，公主身边仅剩下一个儿子和十三个孙子。清军曾声称要礼待明朝宗室，公主于是希望可以得到清廷的安置。
她派人去收田租，但昔日佃户已拒不给租，公主在京中的十余处大房产也被清廷征做了军队用地。公主和子孙被赶回丈夫老家固安县。（1647年）公主最终在北京去世，享年65岁。这一年，随着惠王朱常润和公主的故世，明神宗亦无在世子女。荣昌公主一生既见证了大明的繁华，又见证了大明的衰败。只是晚年太过悲凉。
