但此时，出发时高达17万人的东归队伍，经过惨烈的战争、战乱和恶劣的环境，人口只剩4万多人，已不足出发时的四分之一。能上战场的青壮牧民伤亡更是惨重。与此同时，土尔扈特部发现，舍楞等人的情报并不准确，准噶尔汗国故地并非无人之地，而是被清军牢牢占据。
同时，在土尔扈特部尚未到达伊犁河之前，清军也接到了土尔扈特部即将到来的消息，由于并不清楚土尔扈特人的来意，乾隆为以防万一，一边让伊犁将军舒赫德加强伊犁河一带的防务，一边在喀尔喀、杜尔伯特等地抽调兵力，加强伊犁河的兵力。
土尔扈特部西迁与东归
东归接近完成的土尔扈特部面临的局面变得十分艰难：后又沙俄和哈萨克的追兵，前面又是早有准备，实力强大的清军。元气大伤的土尔扈特部，完全不具备击败此地清军的实力。因此，在渥巴锡为首的土尔扈特部首领进行七天的"扎尔固"会议讨论之后，他们改变了最初的政策，决定归顺清朝。
最终，到达伊犁地区之后，渥巴锡率部归顺清朝，乾隆皇帝在令伊犁将军暂时安置土尔扈特部后，又马上派人将渥巴锡等土尔扈特部贵族领到热河木兰围场，亲自接见了渥巴锡等人。而乾隆皇帝大度地接受了土尔扈特部，并将其安置在新疆一带。土尔扈特部东归，至此彻底完成。
