曾国藩对李秀成"甚怜之"，甚至故意违背慈禧的旨意，未将其押送至北京凌迟处死，而是在南京就地枭首。行刑当天，曾国藩特意派幕僚李鸿裔面见李秀成，向他通报"国法难逭，不能开脱"，李秀成听后谈笑自若，对李鸿裔说："中堂厚德，铭刻不忘。今世已误，来生图报！"李秀成因此也成为太平天国被俘将领中下场最好的一个，是唯一一个没有遭受凌迟酷刑之人。
淮军统帅李鸿章也与李秀成打过很多次仗，他在写给曾国藩的密信中，赞叹李秀成是"英雄人物"。
更让人意外的是，清军中的洋枪队戈登曾经在给母亲的家信中这样评价李秀成："你能有幸目睹忠王的风采，你就会相信，像他那样的人，注定会成功。不论抚台(李鸿章)、恭亲王还是别的满清王公贵族，在他面前都相形见绌。忠王冲锋时身先士卒，锐不可当。他是叛军拥有的最勇敢的、最有才能的、最有创业精神的领袖。他是唯一的一位死了值得惋惜的叛军领袖。"
李秀成被处死后，江苏常熟"民间（为其）焚纸钱，灰积如阜"。梁启超记载："苏州之民，男女老幼，莫不流涕"，至今常熟仍有忠王报恩碑这一历史遗迹。
