最著名的有隐居说，自焚，回宫说以及削发为僧。而这削发为僧是最有可能的。据说当时明惠帝走投无路时，明太祖贴身太监把匣子打开了。里边有三张度牒，就是做僧人的身份证，上面写好了明惠帝等三个人的名字。还放着一把剃头刀、三件僧衣、白金十锭、遗书一封。当然，这也可能就是个故事。
那么，明惠帝到底去哪做和尚了呢?有三个地方最为可能，分别是江苏吴县，贵州安顺平坝县内的高峰寺以及浙江兰溪东山。
还有另外一种说法，就是明惠帝从南京城逃出之后，辗转来到泉州，流落到了海外，后来明成祖继位之后，派郑和出海，就是为了寻找明惠帝。
明惠帝从密道中逃出京城之后，看见北方的道路全是搜寻他的人，于是就化妆南下了。后来到了武昌罗汉寺，这里的住持看过明惠帝的度牒后，赶紧将其藏在了寺中。过了一段时间，他们又在主持的帮助之下做船前往了泉州开元寺，然后辗转逃到海外。
但是无论怎样，这件事始终是个谜底，历史也已经过去了很久，真相恐怕也已石沉大海！
