但随着国民党政府在内战中一败涂地，逃到台湾后又惊魂未定，在惶惶不安中，原子弹之事就被搁置了。
到了60年代，大陆军力已经今非昔比。当罗布泊升起了蘑菇云之后，蒋介石顿时焦虑不已，他对美国中情局驻台官员克莱因抱怨道：
“中共对于核子武器能力，倘以一月制造一颗来论，一年就有十二颗……中共对外宣传，说现有核弹可以炸毁台湾，届时即是第七舰队要来保卫台湾，亦不可能了……我军民心理上都有空前的恐惧和忧虑，这是不容忽视的心理趋向。”
▲其实，老蒋心里慌得一比
克莱因表示，美国会提供核保护，但蒋介石并不敢把希望寄托于此，他下令在几个官邸大修防核掩体，台湾各地频繁举行防空防核演习，警报声充斥全岛。
同时，“国防部次长”唐君铂受命筹建“中山科学研究院”和核能研究所，并有拨款1.4亿美元，用于核武器研发。
在大陆拥有核武器后，美国一度默许台湾发展核技术。不过，美国认为，台湾“拥有大量在美留学并获得高学历的科学家，但是他们并不具备自身发展核武器的能力，因为不得不进口一些不受安全保障监督的核材料”。
