2022年1月24日，美国海军一架F-35C在"卡尔·文森"号航母上着舰时，航线过低，撞上舰体结构。飞行员跳伞成功，两个月后飞机残骸被打捞起来。
2022年10月19日，美国空军一架F-35A从犹他州希尔基地起飞后坠毁，飞行员跳伞成功，事故原因还在调查中。
除了坠机事故，F-35的严重事故还有很多。
2014年7月23日，美国空军一架F-35A的发动机起火，飞行员安全逃生成功。事故原因是发动机转子叶片与机匣间隙过小，摩擦生热导致起火。事故后，普拉特-惠特尼对所有发动机加强磨合，并修改了叶片和机匣的设计和制造。
2021年3月12日，美国海军陆战队一架F-35B从犹马基地起飞，在空中射击训练时，一发炮弹刚出膛就爆炸，幸好飞行员没事，也能马上把飞机安全着陆。
2022年1月4日，韩国空军一架F-35A在低空飞行训练中，飞行员听到砰砰的敲击声，然后很多机上系统宕机了。塔台命令飞行员跳伞，但他认为发动机和基本飞控还是好的，坚持飞了回来。但机上其他系统全面宕机，连起落架都不能释放，最后是以机腹擦地着陆的。
图：韩国F-35A机腹擦地着陆
战斗机训练是高危作业，坠毁要尽量避免，但还是会发生，F-35也不例外。有坠毁事故不意外，意外的是各种"不应该"。
很长时间以来，欧美飞行员的训练和战术水平较高。恰克·耶格号称只要有翅膀的东西都能飞起来，英国"喷火"式战斗机飞行员在战时用机翼撩拨德国V-1飞航式导弹的弹翼导致失控坠毁，都是艺高胆大的佳话。但现在，飞行员素质下滑了。
海上海天一色，中低空飞行时，单靠视觉和平衡感，容易出现分不清海面和天空的情况。这是从飞机在海上飞的时候就知道的问题，最重要的是相信仪表，加强自律，抵制错觉。日本飞行员在二战时代就在海上飞，战后依然如此。空自与其说是空军，不如说是海岸防空力量，海上飞行是基本功。细间少校已经是资深飞行员，F-35A上相关仪表齐备，也没有任何报导指向系统故障。他在事故前要求停止训练，可能已经发现有空间错觉问题，但还是没有能够抵制错误的直觉，相信仪表，这是素质问题。
英国空军F-35B的事故更加荒唐。这确实是空军的，从"鹞"式时代开始，空军的STOVL战斗机就在航母上部署，现在也是一样。事故报告说是起飞前检查中，没有发现有些发动机罩盖没有取下，导致发动机进气不足和出力不足，飞机没有足够的起飞动能，滑出滑跃甲板后直接坠海了。
这是地勤和飞行员的共同责任。飞行员在起飞前要绕机一圈，确认飞机处于适合起飞的状态。这样马虎的检查只能说是素质问题。但这个结论有疑问。发动机罩盖没有取下的话，发动机加速到全速时很可能发生强烈喘振，很难不被飞行员发现。但也可能飞行员觉得已经过了停机、放弃起飞的关键点了，只能将错就错。
美国海军陆战队F-35B与KC-130J空中相撞只能是F-35B飞行员的人为错误。KC-130J在加油作业中，维持恒速定航向飞行，受油机慢慢接近、对接上软管加油头。但这一次，受油机直接撞到加油机上去了。
美国海军F-35C撞上甲板也是飞行员托大，在小航线转弯后直接下滑着舰。发现高度不足的时候拉起已经来不及了，最终发生撞击。
但飞行员错误与系统设计错误互相叠加，导致了2020年5月19日埃格林F-35A的坠毁。
事故飞行员也是资深少校。在夜间训练返航着陆时，头盔显示系统的故障弄得飞行员心烦意乱，动作变形，着陆时的迎角只有5.2度，而正常的着陆迎角应该13-14度。接地速度高达202节（约374公里/小时），比规定速度高了50节（约93公里/小时）。最后接地动作完全变形，不是主起落架首先接地，而是差不多三点同时接地。接地速度过高，姿态不对，造成飞机在跑道上反复弹跳。试图复飞则速度不足，最后飞行员弹射逃生。飞机冲出跑道后，翻滚烧毁。
