打击了对手后，韩侂胄慢慢的大权独揽，他开始筹划北伐。首先，他追封岳飞为鄂王，随即削去秦桧的王爵，并把谥号改为缪丑，下诏追究秦桧误国之罪；然后启用一大批主战的官员，一代词人辛弃疾就在其中；准备就绪后，在1206年，宋宁宗下诏北伐金朝，史称"开禧北伐"。开战之初，南宋还是收复了一些地方，如泗州等地。可惜后来由于韩侂胄用人不当，加上南宋又出了一个内奸吴曦，第二年这场北伐便以南宋失败收场了。
在之后南宋与金朝的谈判中，金朝要求韩侂胄的人头才答应休战。此时的南宋朝廷早已被主和派控制，韩侂胄被杨皇后和史弥远设计劫持至玉津园杀死，函首于金。时年五十五岁。1208年，南宋王朝与金朝签订了"嘉定和议"，宋朝皇帝与金朝皇帝的称谓由以前的侄叔改变为侄伯，屈辱之极。
看到这，其实韩侂胄不算奸臣，相反他还是当时南宋朝廷中少有的有骨气的人。可韩侂胄为什么会被认为是"奸相"呢？很大程度上是因为庆元党禁。韩侂胄这个人特别痛恨理学，他指称其为伪学，打击理学人士，封禁理学。当时理学的领袖朱熹就受到了打击，他被贬职，还被迫上表认罪，说自己是"草茅贱士"，"章句腐儒，唯知伪学之传，岂适明时之用" 。韩侂胄算是彻底把朱熹得罪了。
正因韩侂胄强力打击里学，长期遭到程、朱门徒的咒骂。元代修《宋史》，特立《道学传》推崇程朱，又依南宋《国史》立《奸臣传》，将韩侂胄与秦桧、贾似道等并列，于是"奸相"的名声算是定了。而颇具讽刺意味的是，金人反而对韩侂胄极其尊重与崇尚，佩服他的气节。
