绍兴三十二年(公元1162年)五月，赵构退位，赵昚登上皇位，是为宋孝宗。与赵构不同，赵昚是一位胸怀大志，抗金复国的有为之君。宋孝宗为了鼓舞士气，兴师北伐，登基之初即打着高宗的旗号下诏："追复岳飞原官，以礼改葬，访求其后，特与录用。"
当年十月，又颁发正式文告，宣布追复岳飞"少保、武胜定国军节度使、武昌郡开国公、食邑六千一百户、食实封二千六百户"之待遇。(《金佗编》卷十三)岳飞生前所任职务，均位宋代文武官员前列，地位高于《水浒传》里的殿帅府太尉高俅，大约相当于今之军委副主席。这样一个功勋卓著、地位崇高的国家领导人蒙冤而死，要平反昭雪，必须分清是非，公开承认错误，还岳飞以清白。
但在宋廷的平反告词中，对岳飞之死却写得云山雾罩："会中原方议于櫜弓，而当路力成于投杼，坐急绛侯之系，莫然内史之灰。"借用西汉周亚夫之冤狱喻指岳飞之死，实际上承认了这是冤案。然而，虽然名义上为之平反，却又不肯明言直说。不过，宋廷对岳飞"近畿礼葬，少酬魏阙之心，故邑追封，更慰辕门之望"，"岂独发幽光于既往，庶几鼓义气于方来。"
(《金佗续编》卷十三)倒是体现了孝宗的本意。隆兴元年(公元1163年)，经岳飞家属要求，给还了岳飞原有田宅。淳熙五年(公元1178年)，应岳飞之子岳霖的要求，发还了宋高宗写给岳飞的全部"御笔"、"手诏"(秦桧为陷害岳飞，曾从岳家抄走)。让人不解的是，虽然朝廷恢复并给予岳飞家人种种待遇，却对岳飞冤狱并未进行任何的甄别与复查。
由此可见，宋孝宗对岳飞冤案的平反昭雪，不仅不够彻底，而且留了尾巴。比如，在朝廷文告中，涉及岳飞死因，只讲"坐事以殁";涉及岳案性质，只字不提"冤狱"。尤应指出的是，孝宗对岳飞冤狱所有的制造者包括秦桧、张俊、万俟卨等人，一概未予追究。其实，赵昚并非不知岳飞冤情，他在私下接见岳飞之子岳霖时曾明确指出："卿家冤枉，朕悉知之，天下共知其冤。"(《金佗编》卷九)
