秦钜到任后，加紧训练军队，增置守城器械，组织老百姓加固、增高城墙，挖深加宽护城河，并在城外挖掘堑壕、构筑工事。他经常士兵们同甘共苦。慢慢地消除了人们对他身世问题的误解，他也赢得了蕲州知州李诚之的尊重。
1221年2月，金兵对蕲州发起了猛烈进攻。秦钜迅速布防，并招募敢死队出城迎敌，杀敌无数。不久，金人大举增兵，将蕲州团团围住。秦钜和李诚之带领士兵，昼夜坚守在城墙上，屡挫敌军。金将得知秦钜是秦桧曾孙，就派密使前来劝降，他不为所动，誓与蕲州共存亡，并杀了密使。
蕲州的守城兵力只有三千，而金兵有十万余人。秦钜和李诚之一边组织百姓轮流上城御敌，一边向朝廷求援，但援军迟迟不到。金人架设大量火炮、石炮向城中发射，掩护着金兵架云梯攻城。守城官兵全部殉国，李诚之拔剑自杀。秦钜身受重伤，为了不使钱粮落入金人之手，他回府街点燃仓库，自己也被烧死了。秦钜被追封为正节候，宋宁宗亲自题字"褒忠"。
秦钜的报国壮举，有力回击了封建的血统论，逆转了秦氏家族奸贼的形象。
