先后都受过很多的伤，他在年轻的时候没有什么感觉，到了年纪大的时候，就慢慢的显露了出来，而且他在每次生病的时候都说，我这戎马一生，历经了二百多次战争，前前后后流的血都能有好几盆了在，怎么可能不生病呢？在玄武门事变后，秦琼就慢慢的淡出了政治的舞台，从此就没有在领兵作战，到了后来去世后，有过他的记载，在受到封翼国公的时候也是李渊在位的时候。
但是参加玄武门事变后主将名单上是没有他的名字的，虽然说他是开国的重要大臣，但是他却不是拥护着李世民上位的功臣。第二是三朝元老是程咬金，他是唐朝的第一大寿星，虽然说程咬金在战斗能力上肯定是没有秦琼厉害的但是程咬金的身体好，活的时间也久，凌烟阁有二十世位功臣，除了徐茂公这个老神仙之外，活得最久的就是程咬金的。
