按说这样一位官宦世家的公子，前途一片大好，怎么会和农民起义搅合到一块呢？这还得从崇祯十三年，李自成在从巴西、鱼腹诸山突围出来，轻骑由郧县、均县走河南，在河南这里，李自成多次开仓振粮，收留饥民补充实力。李岩平日里对官吏欺压百姓深恶痛绝，尤其是杞县的官吏们不管百姓死活，以剿匪为名横征暴敛，许多百姓被迫流亡。这一切让年轻的李岩开始对官府失去了信心，开始产生反抗意识。不久，听说闯王进了河南，积极救助饥民，深得民心，李岩不禁心生敬仰，于是收拾行装，辞别家人投奔闯军。
李自成也从部下那里听说了李岩的大名，于是亲自接见了他，二人初次见面，交谈甚欢，大有相见恨晚之意，李自成当即提拔李岩为将并兼领军师。李岩还向李自成举荐了牛金星，而后牛金星又举荐了宋献策，这三人构成了李自成身边核心的谋划团队。李岩建议李自成“尊贤礼士，除暴恤民，”，“假行仁义，禁兵淫杀，收人心以图大事”。特别值得一提的是，李岩很懂得一些舆论宣传的奥妙，他派人扮成商人，在民间广布流言：“闯王仁义之师，不杀不掠”；还编出童谣，让小儿到处传唱：“开了大门迎闯王，闯王来时不纳粮”，“早早开门拜闯王，管教大家都欢悦”。就是在这一年，嗷嗷待哺的河南饥民如大旱之望云霓，“惟恐自成不至”，“从自成者数万”；李自成从此走出隐伏商雒山中时的低谷危厄，面前展现出柳暗花明的转机。完全可以说，崇祯十三年后农民起义军的辉煌，李岩是多有建树、立了大功的。
得了李岩让李自成如虎添翼，闯军迅速在河南站稳脚跟，实力进一步膨胀，尤其是获得了百姓的拥戴让闯军在河南进军顺利，多次大败官军，让朝廷极为震动。
公元1644年，明崇祯十七年三月，李自成大军攻破北京，崇祯皇帝殉国，李自成正式迎来了他人生的巅峰时刻，坐上了北京奉天殿的龙椅。
不过，这个时候的李岩却开始被李自成疏远了，李岩提出续用明朝旧臣以安朝政，严肃军纪防止扰民和招抚吴三桂父子等重要建议。从这几条建议中可以看出，李岩极富远见，大顺军在北京根基未稳，唯有利用明朝旧官吏才能迅速稳定朝局，恢复朝廷行政系统运行，另外，百姓都在观望大顺军，如果不严肃军纪，那么将士们在北京必然会侵扰百姓，起义军靠的就是百姓支持，民心万不可失。最后，关外吴三桂手中掌握着明朝最后一支精锐部队关宁军，这支部队对大顺军是极大的威胁，加上吴三桂担负辽东防御，无论是明朝还是大顺朝都得靠着山海关挡住关外的清军，因此招降吴三桂是极其重要的。
