汉武帝愤怒地认为司马迁是以称颂李陵来讽刺李广利，所以不让他把话讲完就将他交付理官（狱官）审理。于是，司马迁被关进监狱里去了!这是天汉三年（公元前98年）的事情，而李陵败降匈奴是在前一年冬天。
第二年又有一个天大的误会发生了，使司马迁和李陵的处境急转直下。天汉四年（公元前97年）春，汉武帝命公孙敖率领军队深入匈奴，以便迎接李陵归国，显然汉武帝此时对李陵已全然谅解，而这段时间，司马迁之所以迟迟未被定罪，与汉武帝这种心情或许也有关系。
这个行动如果成功，可能也会对司马迁的判决产生良好的影响。可惜，公孙敖无功而还，而且带回一个要命的情报，说他从捕得的俘虏口中得知，李陵正为匈奴练兵对付汉帝国，并把自己无功回来的原因，归因于李陵个人身上。
