焦头烂额的清廷，又迎来了一件难事，新疆到底要不要？清廷朝堂上展开了一场辩论。以当时满族八旗为主的贵族官员，都主张能妥协就妥协，并且大肆宣传投降论调，认为新疆之地，土地贫瘠，且路途遥远，千里之遥，行军也非常困难，打过去也是耗费军力，还不如把省下来的钱投入海军建设，巩固海防。
这个分析，诈一听还是很有道理的，当时慈禧太后也被说动了，准备放弃新疆。就在这关键的时候，左宗棠决然地站了起来，他指出，大清可以丧失任何地方，唯独不能丢新疆，否则国将不国。他表示："我朝定鼎燕都，百数十年无烽燧之警……是故重新疆者所以保蒙古，保蒙古者所以卫京师……若新疆不固，则蒙部不安……防不胜防，即直北关山，亦将无晏眠之日。"
这段话的意思就是，清朝定都北京，数百年来没有入侵警报，原因就是有新疆在，新疆在，那么蒙古就是安全的，蒙古安全，那么京师就是安全的，如果把新疆丢了，蒙古肯定也不会安宁，到时候一垮全跨，北京将永无安宁之日了。
可以看到，只有左宗棠睿智地意识到了问题的严重性，新疆的重要性，不在于其土地的肥沃与否，而在于其战略纵深意义。如果丢了新疆，蒙古也保不住，如果蒙古也丢了，那么京师将直接暴露在外部势力的威胁中，永无宁日。
