原来，就在被封为靖南王这一年，有人上报清廷，说耿仲明的手下私藏逃人。多尔衮过问此事，耿仲明不敢马虎，结果一查，差不多藏了300多人，于是上疏请罪。
当清廷正在争议，该如何给耿仲明定罪时，耿仲明却在行军途中自缢而死。
耿仲明死后，按理，耿精忠的父亲耿继茂该袭承爵位。但多尔衮却以耿仲明不是"令终"，所以不但不允许赐祭，还不同意让耿继茂袭承爵位。
直到1651年，顺治亲政后，耿继茂才袭承了爵位。
耿继茂为了得到清廷的信任，联合平南王尚可喜继续攻克城池。在攻陷广州后，把那些守卫家园的百姓屠戮殆尽。随后，他又帮助清廷消灭南明势力，最终重新得到清廷的器重。
