后来他曾经短暂去东北再度当差，或许不适应东北的环境，他生病了，不得不返回北京。寺庙里有40来个和他一样命运悲苦的太监，孙耀庭曾经以为这样的日子便是永远，他要捡一辈子废品，像蝼蚁一样卑微辛苦地勉强活下去。
幸运的是，解放后孙耀庭终于得到关照，过上了平静安稳的生活。他为此感到激动不已："太监也有了幸福生活！"最初孙耀庭虽然没工作，但每月依然可以领到16元生活费；他想靠劳动赚钱，便去管北京的寺庙、做出纳，像普通人一样领工资。
即使因为身体原因无法组建新家庭，他对晚年隐居的平凡生活也感到非常满足。去世前30年，孙耀庭终于体会到靠努力被人尊重的感觉，但他内心依然有些敏感，临终前交代遗愿希望不要为他洗澡。
1996年，孙耀庭去世，享年94岁。他去世前，以他个人经历改编而成的《中国最后一个太监》电影便上映了，这部影片被评价"有批判性和人情关怀"，恰到好处地展示了孙耀庭在时代背景中身不由己的命运。
