第一、在政治改革上，吸取了权相秦桧长期位居宰相，形成盘根错节势力的教训，开始缩短宰相任期。从这一点就能证明，宋孝宗是善于思考的，在储君期间，一直在观察宋高宗赵构的朝中态势。赵眘时刻提防宰相发展个人势力，形成朋党。同时，严格限制外戚干预朝政。
第二、为岳飞平凡。绍兴三十二年（1162年），赵眘在登基之初，就打着宋高宗的旗号下诏："追复岳飞原官，以礼改葬，访求其后，特与录用。"当年十月，又颁发正式文告，宣布追复岳飞"少保、武胜定国军节度使、武昌郡开国公、食邑六千一百户、食实封二千六百户"的待遇。
1163年，归还了岳飞原有的田宅，1178年，赵眘应岳霖要求，发还了宋高宗给岳飞的全部"御笔"、"手诏"，这些都是当初秦桧抄岳飞家的时候抄走的。
应该说，赵眘对岳飞的平反，对南宋一致抗外的凝聚力起到了极为重要的作用。
