清军引兵入关后，为了笼络人心，多尔衮下令，五月初六至初八，为崇祯帝哭灵三日，上谥号怀宗端皇帝，后来又改称庄烈愍皇帝。并将他和周皇后的棺木起出，重新以皇帝之礼下葬，葬在昌平明皇陵区银泉山田贵妃陵寝内，妃陵改称思陵，一后一妃陪着崇祯去往另一个世界。
长平公主在京城游荡了几天，看到父母终于入土为安，长平公主虽然国破家亡，也终于得到了一丝安慰。但是，其后她再也没有得到三个弟弟的丝毫消息。与她相依为命的，这时只有崇祯的袁贵妃。袁贵妃虽然重伤，最后也象长平那样死而复苏。
清顺治二年，长平公主向顺治帝及摄政王多尔衮上书，说"九死臣妾，跼蹐高天，愿髡缁空王，稍申罔极。"她希望自己能够出家为尼，断绝这尘世间的哀伤悲痛。然而，她是先朝长公主，为了让汉人归心，这个愿望，清朝廷是不会答应她的。不但不答应，在长平公主上书不久，顺治帝的诏命就跟着下达了，不许公主出家，而是让她与崇祯为她选定的驸马周显完婚，并同时赐予府邸、金银、车马、田地。但仅仅过了几个月，长平公主就病逝了，时为顺治三年，长平公主十八岁。赐葬广宁门外。
另外，据张廷玉的《明史.公主传》记载"长平公主，年十六，帝选周显尚主。将婚，以寇警暂停。城陷，帝入寿宁宫，主牵帝衣哭。帝曰："汝何故生我家！"以剑挥斫之，断左臂；又斫昭仁公主于昭仁殿。越五日，长平主复苏。大清顺治二年上书言："九死臣妾，跼蹐高天，愿髡缁空王，稍申罔极。"诏不许，命显复尚故主，土田邸第金钱车马锡予有加。主涕泣。逾年病卒。赐葬广宁门外。"《明史.流贼传》记载"长公主绝而复苏，舁至，令贼刘宗敏疗治。"基本上与上面的说法相同。
但这只是历史的一说，还有一种说法，说长平公主没有死。而是出家做了尼姑。这个故事在民间传说和武侠小说中十分的流行。大致说有一位武功超凡的独臂女尼，乃是明崇祯皇帝的嫡出长平公主，因为国破家亡，被父亲砍去手臂后流落民间。怀着深仇大恨的公主练就了一身武功，誓要为父母报仇雪恨。人称独臂神尼九难。传说独臂神尼九难收了八个天下无敌的徒弟，其中有个吕四娘。吕四娘是九难的关门弟子，后来潜入深宫，刺杀了雍正皇帝，辗转为师父报了家国之仇。这八个了不起的徒弟，被称为"清初八大侠"，威震天下。
（本篇完）
