并且，顺治年间发生的"哭庙案"被杀害的金圣叹、倪用宾等人就是朱国治强加罪名进行的诬陷，因为，清政府缴粮严重，苏州的几个秀才就去文庙里以哭诉作为抗议和请愿。这也是苏州历来的传统，特别是明朝期间，如果，百姓有对朝廷或是地方官员的行为不满的时候，就可以用这种"非暴力不合作"的态度进行无声的抗议。而不巧的是，这个时候正好赶上顺治帝驾崩，金圣叹等人因为此举而被朱国治冠上对皇帝大不敬的罪名"摇动人心倡乱，殊于国法"，最终，被朝廷杀头问罪了。
朱国治随着官位上升，贪婪的欲望也随之增加。并且，朱国治将从百姓中搜刮的钱财更多应用在打理朝廷高级官员，明珠和索额图两大党派都收到其贿赂，康熙皇帝对于这个没有才华和供给的汉人给予重望，并且，将其受封为太子少保，在后来平定三藩之时，康熙皇帝让其担任天朝使者，可见，朱国治在康熙眼中是何等重要。
就在康熙把他任命为云南巡抚后，他的贪欲更加变本加厉，甚至，见面礼都被他明码标价了，如果有的清官拿不出来，那以后的日子可就有的受了。大理知府因为清廉无法上缴朱国治标明的见面礼而被逼到哭诉不已，最后，还是吴三桂帮他交上了这笔银子。
最终，也正是吴三桂把这个名为清官，实为贪官的朱国治送上了黄泉路。康熙十二年（1673年），吴三桂后期起兵叛乱，正在康熙犯愁打算找人去劝降吴三桂的时候，康熙想到了一向口才好，能说会道的朱国治。
