郑崇俭率领贺人龙、李国奇入蜀，会合左良玉，在玛瑙山之战中，大破张献忠，"获首功千三百三十有三，降贼将二十有五人，获马骡、甲仗无算"。这一仗，郑崇俭亲临前线，指挥战斗，而杨嗣昌远在襄阳。到了论功的时候，郑崇俭得到的赏赐仅为杨嗣昌的一半。
之后，郑崇俭继续率领军队追击，取得了赫赫战功，"先后斩首千五百级，其党顺天王、一条龙、一只龙皆降"。当时，郑崇俭领兵在五天内取得三次胜利，"崇俭军五日三捷，威名甚振"。郑崇俭毕竟年纪大了，他打算急流勇退，于是向朝廷提出告老还乡，不过被崇祯帝拒绝。
崇祯帝还下旨，让郑崇俭返回西安，留下贺人龙、李国奇继续讨贼。后来的事实证明，崇祯帝的决策是错误的，假如他让郑崇俭继续领兵讨贼，很有可能取得最终的胜利。可是郑崇俭一走，诸将群龙无首，不能齐心协力，结果让张献忠再度崛起，"蜀中由是大乱"。杨嗣昌趁机诋毁郑崇俭，说他"撤兵太早，致贼猖獗"。于是，崇祯帝命人将郑崇俭革职。
