锦衣卫直接受命于皇帝，而不受其他大臣的干扰，所以明朝的大臣对锦衣卫都非常恐惧。而锦衣卫有时候为了邀功，也常制造冤假错案，还扩大范围，导致人心惶惶。他们又拥有特权，经常为非作歹，皇帝也成为他们的保护伞。因此锦衣卫被认为是明朝灭亡的原因之一。
第二就是重用宦官。宦官权力特别大，可以呼风唤雨，很多大臣都不敢得罪宦官。而这两个特点，也为世人所诟病。
明朝最出名的一个宦官就是魏忠贤。提到魏忠贤，就会想到他是一个权倾朝野，残暴，无恶不作的奸人，而这位大名鼎鼎的人物就是被崇祯所杀。
而崇祯的哥哥明熹宗死前就叮嘱崇祯，不要杀了魏忠贤，说他是在大事之时可以用到的人。但是崇祯却没有听哥哥的，登位之后第一件事就是杀了魏忠贤，一定程度上打击气焰嚣张的阉党。
