与此同时，明仁宗派官员修葺南京的宫殿，还让皇太子朱瞻基驻守南京，支持迁都的准备工作。迁都北京是朱棣一生中做出的一件大事，从即位开始，一直忙活了十八年才算结束。如今成为都城不过四年的时间，朱高炽为何违背父皇的意愿，打算重新将都城迁回南京呢？
首先，最主要的是经济原因。自唐宋以来，中国的经济重心就已经南移，到明朝时期，南方已经成为全国的经济重心。迁都北京后，每年都需要从南方运来大量粮食、物资，来供给朝廷的开支。这一点正如朱高炽所说的，"南北供亿之劳，军民俱困，四方向仰，咸仰南京，斯亦吾之素心"。
其次，政治因素也很重要。朱棣虽然迁都北京，但朝廷内部还有一些官员是反对迁都的。到了永乐十九年四月，也就是迁都北京后的第四个月，雷电击中紫禁城三大殿，引发火灾，将三大殿全部焚毁，这引起了朝野的震动。朱棣为平息舆论，甚至杀死了上书言事的官员。
