第二点，就是孔融在朝中的位置。建安元年，汉献帝正式迁都许昌，曹操开始挟天子以令诸侯，每当朝会皇帝征召对策的时候，孔融都会引经据典，给皇帝拿主意，而其他的官员，就跟摆设一样，这使得孔融在朝中很有作用。朝中发生的很多事，汉献帝都会征询孔融的意见，曹操怎么可能忍受这样的大臣存在，皇帝有事必须要问他才对。
第三点，也是最重要的一点，孔融已经看出来曹操的心思，他俩不是一路人。曹操虽然当时表面上尊重皇帝，但是明眼人能看出来曹操的野心，孔融自然也看出来了，所以他对曹操很多反感，说话也越来越狠，经常惹的曹操大发雷霆，但是曹操都忍了。但是，孔融经常讨论国事，更重要的是这些事都限制了曹操的发展，这样的人曹操当然不能留。
公元208年，东汉名士孔融被曹操指使丞相军谋祭酒路粹编织罪名，上奏孔融"招合徒众"、"欲罪不轨"、"谤讪朝廷"、"不尊超仪"等罪名被杀害，终年五十六岁，当时孔融的家人也被牵连，几乎都死了。曹操网罗的罪名很有意思，尤其是这个不尊超仪，说孔融不孝，要知道当年孔融就是以孝顺闻名，这样不仅杀人，还毁他的名，可真的是够狠的。
