建文帝的妻子马皇后是光禄少卿马全的女儿。她于洪武二十八年（1395年）嫁给当时还是皇太孙的建文帝，并被册封为皇太孙妃，建文元年（1399年）册封为皇后。建文四年（1402年），朱棣率军攻破南京城后，马皇后在宫中自焚而死，终年25岁。
建文帝与马皇后共生有二子。长子朱文奎在建文元年（1399年）被立为太子。朱棣攻入南京后，朱文奎与建文帝一起失踪。当时在大火过后的废墟中找到了几具烧焦的残骸，有人认为这几具残骸分别是建文帝、马皇后和太子朱文奎。
建文帝的次子朱文圭出生于1401年，朱棣攻入南京时，朱文圭刚满二岁（虚岁）。然而朱棣并没有轻易放过这个连站都还站不稳的小娃娃。从1402年起，朱文圭便被长期囚禁于凤阳，他也不配再拥有自己的名字，而被朱棣下令改为"建庶人"。
五十五年后，明英宗（朱棣的曾孙）通过"夺门之变"重新从明代宗手中夺回了皇位。明英宗想起自己被幽禁的这几年日子过得实在艰辛，由此他想到了自幼就被囚禁在凤阳的"建庶人"。于是明英宗下旨恢复"建庶人"的自由，可是重见天日的朱文圭在此时却已是不辨牛马。获释后不到几个月，朱文圭就黯然去世了，终年五十七岁。
