萧何听从了召平的建议，辞让了加封的食邑，并且把全部家财都捐给了刘邦的前线部队。刘邦再次开心了，萧相国又一次平安了。
在这之后，萧何虽然一直小心翼翼，甚至为了打消刘邦对他的怀疑，还强买民田，自毁名声，最终也没有逃脱牢狱之灾。
汉十二年，萧何因为建议刘邦将上林苑中的空地开放给百姓耕种而锒铛入狱。后幸得王卫慰求情而被放出。出狱的萧何老态龙钟，颤颤巍巍，诚惶诚恐，光着脚就忙不迭地向刘邦谢恩，其可怜状无以复加。
可以说，从汉三年开始，萧何的日子就是在胆战心惊中度过的。在这之前，他的作为还可以理解为是为了大汉的江山社稷，在这之后，几乎他所有的行为都是为了能够苟全性命。所以在韩信被诬陷，吕后动杀心的时候，他的第一反应就是寻求自保。
