天花说有许多史料支撑。据记载董鄂妃患病后，身体日益虚弱，最后还感染天花。顺治帝作为一个大情圣，如此宠爱董鄂妃，自然是日夜陪伴照顾，而天花的传染性又非常强，因此顺治帝在照顾董鄂妃的过程中不幸染上天花，最后不治身亡。但是如果是因病而死，就属于自然死亡，毕竟在当时天花就是绝症，《清史稿》没有道理不如实记载啊！难道说顺治帝的死另有他因，而这个原因让史书不便记载？
直到2004年，《厦门晚报》的一篇报道，震惊了史学界。原来是郑叔成，郑成功的后人于1921年据祖上流传匣里的秘本典籍撰写的《延平王起义实录》的民间抄本上记载：郑成功击毙顺治帝于厦门；《厦门晚报》的这篇报道就引用了这个记载。这对史学界来说是一个不小的冲击，如果说这个记载属实的话，那么顺治帝的死因之谜就揭开了。
那么《延平王起义实录》的记载是否属实呢？俗话说得好，无风不起浪；1658年，也即顺治十五年，南明永历政权在云贵一代出没，清军将主力派往云贵围剿，这就导致东南防守空虚。这给了郑成功一个乘虚而入的机会，他开始北伐，全力进攻南京，但是途中遭遇台风，郑成功军队损失惨重，只得重新退回福建。顺治十六年五月，又是一个绝佳的机会，郑成功再次率军北伐，攻下镇江，直逼南京，但可惜的是由于战术不稳，最后痛失攻下南京的机会。两次重创，郑成功无力再次进行北伐，只得凭借海战的优势固守厦门和金门两地，休养生息。
