朱标去世后，朱元璋深感开国功臣会影响大明政权，就开始大肆屠戮功臣，根本上杜绝开国功臣作乱。朱元璋将开国功臣屠戮殆尽，便将不少权利分给自己儿子，让藩王有清君侧权利。
朱元璋规定藩王回京，不能同时回来，只有一位藩王离京后，另一位藩王才能进入京城。朱元璋此举在于杜绝藩王互相来往同中央对抗。朱元璋用心良苦，实际上并遏制靖难之役爆发。
《皇明祖训》中有这样一条"朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。"朱元璋为防止中央有权臣，让各藩王有足够力量清除权臣，确保大明统治安稳。后来，建文帝大力削藩后，朱棣便以"清君侧"为理由起兵"靖难"清除建文帝身边两位奸臣齐泰、黄子澄。
建文帝朱允炆即位后，藩王势力过大，齐泰、黄子澄两人提议削藩，并获得朱允炆默许。建文帝支持下五位藩王相继被废除，让远在北平燕王朱棣深感危机，从而决议起兵自保。
