崔浩被灭族的同时，他的属下给跟着倒霉，"其秘书郎吏。以下尽死"。太武帝亲自审问崔浩，崔浩则"惶惑不能对"。公元450年，太武帝下令诛杀崔浩，押往城南执行死刑的时候，"卫士数十人溲其上，呼声嗷嗷，闻于行路。"
--数十个卫士往崔浩头上、身上撒尿，千古以来，士大夫受刑遭此奇耻大辱者，闻所未闻，这段历史史称"国史之狱"。
崔浩之死，仅仅是因为秉笔直言吗？当然不仅仅是这些，崔浩曾经"欲齐整人伦，分明姓族"，这种尊崇门阀的行为不符合鲜卑人的利益。
《宋书》透露说：崔浩"有异图……谋泄，浩被诛。"这里说他是因为谋反才被斩杀的，当然还有人认为，崔浩笃信道教，煽动太武帝灭佛而得罪了太子。
关于他的死众说纷纭，莫衷一是。有一点是肯定的，北魏是鲜卑人的天下，崔浩作为一个外族人，确实太过张扬了。
