后来的两年时间内，他几乎没怎么和起义军有过正面冲突。那时，他在九江的兵力就有二十万。因为，这些年来他将朝廷的封赏和自己抢来的钱财都砸在了自己的军队建设上，从这一点上看，左良玉还是有点想法的，他应该是看出明朝不行了，便索性做了一个地方的土霸王。
此外，他在对张献忠的态度上，也表现得非常明显。
因为，他和张献忠交手好几次基本都是胜出，但是，张献忠却每次总能逃脱。那么，他为何不赶尽杀绝呢？其实，他非常明白，现在是朝廷要用人，才有他一口饭吃。可是，一旦这些起义军都被灭了，朝廷一定会和他算算前帐的。所以，他还不如留着对方，让这个仗一直打下去，而他也可以继续壮大自身。
后来，南明王朝建立，他和马士英的人脉关系出了大问题。当时，他扛着"清君侧"的大牌子准备去打马士英。可见，这时他的兵力一般人是难以撼动的，只是他还没有到南京，就病逝九江了。谁说武将是莽夫，左良玉这张牌打的就很好，唯独是他的健康挡了道。此外，他身后还有一个幕僚柳敬亭给他出点子，但谁都没有料到，他会中途病逝。
