陈阿娇派人将卫子夫的弟弟卫青抓走准备杀掉，平时有些柔弱的卫子夫，一下子变的强硬起来，竟到皇后宫中向她要人，虽然卫子夫态度十分坚决，但陈阿娇依旧不打算放人，准备当晚将卫青杀掉。然而就在这时，一件意想不到的事情发生了，卫青被公孙敖带人救走了。经过此事卫子夫胎气虽受影响，但见弟弟平安回来，加上太医的精心治疗，她的身体很快就恢复了。
公元前137年，卫子夫生下长公主，没过多久，又生下了两个女儿，因此汉武帝对她集三千宠爱于一身。
由于汉朝巫蛊之风盛行，越来越受冷落的陈阿娇找来一个叫楚服的巫婆，她命楚服“作法”诅咒卫子夫，而且还用楚服带来的毒药给其秘密下毒，很快，卫子夫就病倒了，生命危在旦夕。
卫子夫的身体平时并无大碍，可为何突然这样了呢？汉武帝越想越不对劲，他派人暗中调查此事，很快，陈阿娇和楚服露出了水面。据《汉书》记载，汉武帝一怒之下，将楚服斩首示众，而陈阿娇也受到了严厉的惩罚，免去皇后，打入冷宫。荣宠一时的陈阿娇，金枝玉叶的侯门千金，几年之后，在冷宫中抑郁而终。卫子夫因生下太子刘据有功，被封为皇后。
公元前91年，晚年的汉武帝疑神疑鬼，体弱多病，为此，他离开长安，来到甘泉行宫养病，可病情并没有得到好转，反而逐渐恶化起来，宠臣江充进言，称是有人行使巫术诅咒所致。汉武帝任命江充为御史大夫彻查巫蛊案，据《汉书》记载，因巫蛊案而死的，前后达几万人之多，而江充与太子刘据曾有矛盾，他准备利用这个机会整垮对方，很快，江充带人手持诏命，带兵来到太子东宫。在江充的授意下，士兵们前往东宫的后花园，很快他们就挖出了人偶。太子刘据前往甘泉行宫辩白，却遭到江充等人的限制，情急之下，扮成使者矫诏抓捕了江充，然后被太子刘据一剑刺死。
随后连夜将此事告知自己的母亲，卫子夫认清了此时的形势，与其坐以待毙，不如主动出击。刘据就这样将长安城牢牢控制住，远在甘泉行宫的汉武帝很快得知此事，带兵与太子刘据激战五日，太子不敌，兵败逃亡，最终刘据由于走投无路被迫自尽。而卫子夫因为无法解释自己的行为，以死明志，自尽身亡。就这样，卫子夫的一生，在堂前歌舞的传奇中开始，又在深宫斗争的悲剧中结束。
后人在评价一个历史事件时，一般讲坏事归咎于红颜祸水，很少对男人犯下的错误做出反思，然而一代贤后卫子夫，却用自己的德行，在其含恨死后，使得汉武帝当时就颁布了著名的《轮台罪己诏》，一个女子，第一次让汉武帝低下了头。
