刚开始的时候，邓禹还收了很多流民武装，壮大了自己的力量，被刘秀夸奖。但是后来，邓禹做的事情，让刘秀气的撤了他的大司马之位。当时众多关中军民选择投靠邓禹，因为赤眉军的恶行不得民心，一切形势都有利于邓禹。但是邓禹就是不攻打长安，刘秀下旨苦苦相劝，他也不打。
最后赤眉军扫荡完长安的粮食，拍拍屁股走人了，邓禹赶快占下了空城长安。没想到过了几个月，赤眉军又回来了，因为邓禹先前不愿意攻打，眼睁睁看着赤眉军残害长安百姓，所以那些豪强都不愿意听从安排，士兵没粮食，逃走多半。几百万的军队后来只剩下了几十万，还都是饿着肚子的兵，这怎么能打得过人家，所以，邓禹惨败后，只能逃出长安。
邓禹这个人十分傲，可是派来的李宝态度更是傲得很，几句话没说完，就被愤怒的邓禹拉出去斩了。李宝可是刘秀族兄手下的亲信，他的弟弟知道死讯后，便串通李宝曾经的部下反手给邓禹的汉军一阵痛击。自此之后，邓禹的威望越来越糟糕。
频发战乱之后，关中遇到了饥荒，几乎到了自相残食的程度。邓禹带的汉军也只能挖野菜来吃，正在这时，邓禹不听冯异的劝告，执意攻打赤眉军。打了一天，赤眉军忽然败退，并将粮车都扔下不管了。看到满地豆子的汉军只顾得抢豆子，没人去追击赤眉军。赤眉军回过头来，汉军几乎全军覆没。赤眉军也没吃的，那些粮车下面都是土。
等到邓禹回到朝堂的时候，身边只剩下二十四骑，只能向皇帝认罪，闭门思过。怕输不敢打，后来延误战机输了，输了还被赤眉军戏弄，一输再输，最后连职位都输没了。
