因为在他们之间君臣、主仆关系少之又少，而朋友之间的信任确实日益剧增的。而长孙无忌也很清楚地知道，李世民一直把自己当朋友看待，心里也是十分感激，但是作为君臣关系的他始终是会很尊重李世民的意见，为人也是十分地谦逊，因为他始终知道作为臣子不应该越线，否则不好收场。而内心却是尽心尽责地维护李世民的利益，甚至是将其利益最大化，在这一点上，李世民更是看在眼里，记在心里。李世民由于在战场上的政绩，受到很多的人拥戴，而太子却是嫡长子李建成，这也无可厚非。然而，李建成一度认为自己的太子之位会受到李世民的威胁。于是想方设法，杀之后快。对于李世民天策府下的幕僚也是记恨三分，处处刁难，这使得其部下十分不满。
在宣武门政变之前，当时的秦王一直在犹豫是否要发动政变，毕竟一边是一路拥戴自己的幕僚，一边是自己的父皇和兄弟。经过长孙无忌和房玄龄等人的极力劝说，最终李世民决定发动兵变，而宣武门之变最终也是以胜利告终。李世民登上皇位之后对于跟随自己南征北战的开国功臣其有功进行封赏，其中的二十四位被列入了凌烟阁之列，能够入列凌烟阁之人寓意位列大殿之上，受到皇帝优待的那些人，而长孙无忌位居凌烟阁之首。
