据史学界说明，明朝灭亡的原因，其实鼠疫才是罪魁祸首，在明朝末年，朝廷危机重重，积弊太深，最后众叛亲离，后来被农民起义军的李自成攻破京城，又因吴三桂“冲冠一怒为红颜”向多尔衮打开了大门，导致了清兵入驻了中原。
但史学界普遍认为是鼠疫灭了大明王朝，据史料记载明末大鼠疫开始于崇祯六年，崇祯十四年鼠疫流窜到北京，造成北京人口的大量死亡。北京在1643年的8月到12月间，估计死亡人数已高达全城一半之多。所以当次年的4月，李自成攻进北京城时，他面对这一鼠疫之都只用了两天就把北京城拿了下来。所以他的军队成势如破竹进入北京城，归根结底还是鼠疫造成的，但李自成的大顺军也有一定程度的鼠疫传染。
