最终朱文正走向了一条不归路，他勾结张士诚意图联合对抗朱元璋。其实他也知道如今朱元璋得天下已是大局已定，就算伙同张士诚也难以掀起何等风浪，可他坚持这样做不过是为了得到情感的倾泻，他不能忍受朱元璋对自己的轻视。
然而此事很快就东窗事发，传到了朱元璋耳中。朱元璋大惊，他当面质问朱文正，很快朱文正也承认了自己的所作所为。最后因为自己妻子马氏的劝阻，朱元璋饶过了这个亲侄儿，只是将其左右“皆诛之，及部下随从、头目五十余人，尽皆断其脚筋”。
朱文正虽然意识到了后果，却并未吸取教训。“后复遣文正往濠州祭祀，暮夜与从人议，有异志，从人备告，太祖废之”。朱文正还是有反叛之心，甚至在朱元璋的再次审问下，竟敢公然顶撞。朱元璋一怒之下，只好用铁鞭将其打死了。
这次事件对朱元璋打击极为沉重，他从未想过自己在这世界上唯一的血脉至亲，竟然会因为这等小事就背叛自己。朱文正明明有自己的想法，却一直没有对自己明言，最终反倒责备自己待他不公。自己的亲侄子尚且未能对自己袒露心扉，那这世上还有何人值得他朱元璋信赖。
因此其后朱元璋选择独揽大权，从不相信于他人。而且他为了能够守住他的大权，不惜诛杀数万功臣，因为在朱元璋眼里这些连自己亲人都称不上的大臣，又有何信誉可言。
