且朱棣在对付这些拥护朱允炆的权臣上，手段可以说是无所不用其极，生煮、油炸、剥皮、炮烙........很多当时极有声望的权臣都横遭惨死。比较有名的就是方孝孺了，可以说是史上被皇帝“诛十族”第一人。
说起来，这个方孝孺虽是大儒，但也是腐儒，朱棣是再三容忍方孝孺的，并且还多次提醒他要回避。但是方孝孺不肯，顶针到底，于是朱棣大怒，下令株其十族，还让方孝孺在旁看着，连杀三天三夜。方孝孺本宗、妻子一系，朋友学生847人尽被诛杀，而方孝孺依然脸色不变，最后被朱棣凌迟了。
诛十族的先河开了之后，第二个被诛十族的也来了，他就是景清，因为想要刺杀朱棣败露，被朱棣诛十族，最后剥皮楦草。而兵部尚书铁铉也惨遭油炸。可以说朱棣手段残忍至极，并且对待女子也丝毫不手软。
据传说，朱棣有一宠妃权氏，是朝鲜高丽王进贡的美女，能歌善舞，艳丽非常，朱棣宠而爱之，时常带在身边，就连出征也随身带着。不料永乐八年，权氏随朱棣率兵北征，死于归途，朱棣痛泪。
班师回朝后，被宫人告知是宫中吕妃命人用砒霜害死了权氏。朱棣怒极，也不纠察事实，兴师问罪，直接将吕氏活活烙死，受吕氏牵连，亲朋好友宫女株连数百人。永乐十八年，原本要被朱棣册立皇后的王贵妃暴卒，朱棣伤心欲绝。恰巧此时，又被密报宫妃贾吕同鱼氏私通宦官，朱棣大怒，下令彻查，竟然就出了多年前他们陷害宫妃吕氏的秘闻。随后，贾吕、鱼氏自杀，朱棣犹怒，下令鞭尸。
因为牵扯太广，况且还间接说明了十年前处死吕氏是朱棣昏庸。余怒难消的明成祖便揪出宫中宦官拷问，这群人被逼急，大骂朱棣“性无能”，这下是真把朱棣惹急了，牵连了宫内3000多名侍女内官，多数还是屈打成招的，并且全部被活剐。
朱棣登位后，将忠于建文的诸臣剥皮的剥皮，下油锅的下油锅，把他们的女眷罚到教坊司当官妓，实行残酷的“转营”，即轮流送到军营中去，一个女子每一日一夜要受二十余男子的凌辱，情况还要经常报告朱棣，有被摧残至死的，朱棣就下圣谕将尸体喂狗吃了，这手段可谓是残忍至极。朱棣在位期间一直都在找机会洗白自己，但所做的事情天下有目共睹，这也成了他的终身遗憾。
