一是获得清朝政权的合法性和正当性。众所周知，清朝是一个外来政权。外来政权如何获得合法性和正当性？一个最简便的办法就是以前朝政权的继承者自居。虽然清朝入关时，明朝已经因为崇祯皇帝自缢身亡而不复存在。但清朝统治者总是千方百计想和明朝发生联系。拜谒朱元璋陵墓，即为其具体实践。
二是安抚广大民众，笼络汉人精英。清朝入关后，由于错误地实行了“剃发易服”政策，导致南方一带对清朝发生激烈的抵抗。著名的“嘉定三屠”和“扬州十日”就发生在这段时间。在相当长的时间里，南方还存在浓烈的反清情绪。康熙皇帝拜谒朱元璋陵墓，有助于减弱汉人的抵触情绪，将汉人精英笼络在清廷身边，至少也不要成为潜在的抵抗者。
然而，值得注意的是，康熙皇帝一面给朱元璋扫墓，一面却对他的子孙后代赶尽杀绝。
我们知道，清朝入关后，对明朝皇室极尽刻薄之能事，残暴杀戮，绝不留情。历史学者白新良、赵秉忠所撰写的著作《清兵入关与明朝宗室》中，统计了一排令人触目惊心的数字：从顺治三年到顺治八年，清朝杀戮的明朝皇室，郡王以上有名有姓者有50多人。对于他们的家室，清朝则是全部诛杀。因此，仅仅这5年就杀掉了1万余名明朝皇室。连李自成都没有杀掉的崇祯皇帝3个皇子，最终都被清朝杀掉。
甚至到了康熙时期，清朝统治已经比较稳固，这样的追捕杀戮还没有停止。
崇祯皇帝第五子朱慈焕，在民间隐姓埋名，有幸逃过了清朝初期的杀戮，活到了70多岁。
1699年，就在康熙皇帝拜谒朱元璋陵墓，并题写“治隆唐宋”4个大字后，还向大臣表示，要寻找一名朱元璋的后裔，管理明孝陵：“朕意欲访察明代后裔，授以职衔，俾其世守祀事。”
朱慈焕不是傻子，当然不会真的跑出去接受康熙皇帝的这番“好意”，但他从此放松了警惕，自觉这辈子总算可以善始善终了。
