公元246年，侍中董允去世，陈祗接替他担任侍中，由于陈祗不排斥宦官黄皓，并与黄皓互为表里，使得黄皓开始有机会参与政事。也正是从这开始，宦官黄皓再无人可治，后来他愈发骄横跋扈，不仅逼死了朝中不依附自己的大臣，更是把大将姜维逼得到沓中屯田避祸，最终导致蜀汉的灭亡，因此陈祗也成为了人们口诛笔伐的罪人。
陈祗小时候是个孤儿，在司徒许靖家长大。或许是出生名门世族之家，陈祗虽是孤儿，却是个人才，他在二十岁就颇有名气，不久就被朝廷任命为选曹郎。由于陈祗矜持严厉，相貌威武，擅长多种技艺，还懂得一些旁门左道，因此费祎对他另眼相待，故此破格让他接替董允担任内侍。
