入宫之后，朱棣派人到处寻找侄子的下落，活要见人死要见尸，一日不找到建文帝，朱棣睡觉都不能安稳。士兵不敢懈怠，立即展开地毯式搜索，却一无所获，建文帝仿佛凭空消失了，大臣们也不知道其下落。正当朱棣一筹莫展之际，得到了一条小道消息，史书云：“帝入南京，有言建文帝为僧遁去，溥洽知状，或言匿溥洽所，帝乃以他事禁溥洽。”
也就是说，溥洽作为主录僧，应该知道建文帝逃走的事情，甚至是他把建文帝藏起来了。杀伐果断的朱棣，果断让人把溥洽抓进大牢，逼他讲出建文帝的下落。威逼利诱的手段都用上了，溥洽始终不说一个字，朱棣恨不得下令将他斩首示众，但为了弄清侄子究竟是死是活，只能一直关押着溥洽，不能杀掉他，否则线索彻底中断。
这一关就是十五年之久，无数次被审问，溥洽依旧如从前，无论使用什么手段，始终保持淡定和无所谓的神态，明摆着告诉朱棣：“尽管放马过来，你从我身上得不到任何关于建文帝的消息，就死了这条心吧，有种把我杀掉。”溥洽早已抱着必死的决心，更没有想过或者走出大牢，因为他非常清楚朱棣的手段。
让溥洽没想到的是，自己有出狱的那一天，而且救他的人是朱棣最信任的谋臣姚广孝。姚广孝从未求过朱棣任何事情，对于他的这一请求，朱棣无法拒接，因为他与姚广孝的关系不只是君臣，还是彼此了解的战友。当天，溥洽就重获自由，他跪在姚广孝的窗前哭着说道：“吾余生，师所赐也。”
有人认为，姚广孝助纣为虐，属于乱臣贼子，小编觉得这对姚广孝是不公平的。他作为朱棣的谋臣，帮助主公无可厚非，大明江山还是姓朱，而且他在朱棣称帝后深居简出，几乎不问世事。人之将死，其言也善，想到下落不明的建文帝，想到被诛十族的方孝孺，以及受牵连被杀的大臣，姚广孝心里充满内疚，所以才求朱棣放过溥洽，以减轻内心的愧疚。
