除此之外，他还从事对日走私、贩私盐。最令人气愤的是，高寀还与占据澎湖的荷兰人相勾结，对他们抢夺人口为奴、占领中国领土等事情不闻不问。南路参将施德政派遣沈有容驱逐荷兰人后，断了他的财路，为此他四处为难施德政。就是在施德政升职为神机营右副将军、后军都督时，他也不放过最后的机会。竟然派出数百人将施德政的行囊抢走，想从中找到施德政贪污军款的罪证，结果一无所获。
在福建，上至总督、巡抚、总兵，下到士绅无不与高寀交好。只有前任巡抚徐学聚、后任巡抚丁继嗣、再任巡抚袁一骥、布政使陈志寰、南路参将施德政、海登县知县龙国禄等几个人与高氏为敌。
万历三十年（1602年）漳州月港来了一批商船，因为没有行贿，税使兼市舶司高寀竟然不许一人上岸。归心似箭的船员们奋起反抗，将高寀的随从扣押。与此同时，郑国钦率领百姓将南靖、溪渡口的税吏驱赶。
万历四十二年（1614年）高寀鞭打一位诸生的父亲，导致福州府全体诸生火烧高寀建造的"望京亭"。此后，广东税监李凤病死，高寀要到更富裕的广东去，福建百姓无不欢欣鼓舞。然而，广东人听说此事后，纷纷歃血为盟，只要高寀敢于踏上广东的土地，广东人就揭竿而起。
1614年5月19日，因为他平日里买东西都是赊账，福建商家听说他这一天要离开福建，便前往市舶司衙门讨债。15年来拖欠的数万金银，以及愤怒使人们群情激奋，将衙门团团围住。高寀见状命卫兵鞭打驱赶，商民予以反抗。高寀竟然命人射杀十余人，又放火箭烧毁民居。
