建文帝可能跑了，也可能是自焚而亡。不过这不重要。当时不管朱允炆怎么着，他没自焚也好，不逃跑也好，只要他活着被朱棣活捉，必然是个死。因为史料中对朱棣继位的记载，非常有内涵。
根据史料记载，朱棣初进南京时，城内乱成一锅粥，为了抢占先机，朱棣把兵马分成了四部分：其中实力最强的一队被派去镇压以徐达大儿子徐辉祖为首的抵抗势力；第二队派去天牢释放被建文帝拘押的几个王爷；第三队被派去皇宫，"保护"建文帝。
至于第四队则由朱棣自己亲自带队，作为战场的预备队。
三队人马派出后，镇压抵抗势力的一队进展非常不顺，因为徐辉祖死不投降，跟燕军在城内打巷战。营救王爷的一队则很顺利，被拘押的王爷很快就救出，并送到朱棣面前。
但就在朱棣与弟弟们碰面，抱头痛哭时，第三队的人突然来回报说，皇宫起火了，已找不到建文帝的下落。朱棣听闻大惊，立马增派人手去灭火。表示一定要保护好建文帝。
