但是，要制造出麦田圈并不是一件简单的事，很多麦田圈的图案规整精确、构成复杂，似乎是经过了严密的计算，在纸上绘出这些图案都很费劲，何况要在黑夜的田野中制造出这么巨大复杂的怪圈，而且进行的时候不发出一点声响，不被主人和他的狗发现，如果仅采用脚踩和木板压的方式，在一夜之间弄出麦田圈，仅凭人的体力根本不可能做出来，所以，人为制造的说法也不靠谱。
后来，专家在麦田圈发现了无法解释的离奇现象，麦田圈里的麦子排列非常神奇，它们全都倒下了，但却是一株压着一株交叉倒下的，就像是编好的辫子一样，这是人造麦田圈所做不到的，再就是麦子的性质有了变化，专家做了一个试验，同时在麦田圈里和圈外采集麦种进行培养，他们发现，两处麦种长势有着明显的差别，圈外的麦种生长规律依然保持着麦子的物种特性，但麦田圈里的种子却不一样，有40%已经长得完全不像麦子了，也就是说麦子的基因已经发生变异了。
