但是另外一个调水工程，却不尽如人意了，留下了祸根，成为了生态灾难。它就是大约在美国同一时间段进行的卡拉库姆工程。20世纪50年代，苏联政府为了促进孱弱的农业发展，加快中亚地区棉花的生产速度，故而打算从中亚最大也是唯二的两条河流，阿姆渡河和锡尔河浇灌干旱的盖奥克泰佩地区土地以及海海滨地区
当地生态严重破坏，水中含盐量增加了三倍，沿海沼泽面积大大缩小，大量灌木消失。锡尔河三角洲鸟类减少了135种，咸海鱼类由24种减少到4种。除此之外，当地4万多名打渔为生的渔民，也失去了自己的饭碗，虽然如今的土库曼斯坦政府竭力挽回运河所带来的损失，采取蓄水等方针，依然很难挽回之前咸海的元气。
苏联的教训，也值得每个人思考，人们在改造地球的时候，应该要更加谨慎。